忍者之战（日文︰シノビの戦い）是宝可梦＋信长的野望的一个剧情分类。
概述
该分类包含4个剧情。舞台是夜叉之国、奇岩之国、毒牙之国、飞翼之国、御灵之国、不屈之国、神龙之国、吹雪之国。
在该剧情分类中，全部的训练场只会出现幽灵屬性、恶屬性、毒屬性和龙屬性宝可梦，与玩家阵营不同的敌人、玩家遇到的自由武将也只会使用拥有这4种属性的宝可梦，但若自由武将在其它篇章内收服了其它属性的宝可梦并登陆图鉴，则可以带入该剧情中。
乱世的黑暗面
| 乱世的黑暗面
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| 主角
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小太郎
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| 国家
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东部8国
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| 目标
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统一8国
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| 开启条件
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通关乱世的传说
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| 难度
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★★☆☆☆
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| 描述
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乱世的黑暗面（暂译，日文︰ランセにやみを，英文︰A Shroud of Darkness）是以小太郎为主角的剧本，完成乱世的传说剧情后可以进入。
惩罚坏孩子吧
| 惩罚坏孩子吧
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| 主角
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宁宁
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| 国家
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东部8国
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| 目标
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统一8国
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| 开启条件
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通关让世界笑起来
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| 难度
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★★★☆☆
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| 描述
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惩罚坏孩子吧（暂译，日文︰悪い子はおしおきだよ，英文︰Teaching Them a Lesson）是以宁宁为主角的剧本，通关秀吉剧情后可以进入。
忍者中的忍者
| 忍者中的忍者
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| 主角
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半藏
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| 国家
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东部8国
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| 目标
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统一8国
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| 开启条件
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通关和平之后的愿望
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| 难度
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★★★☆☆
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| 描述
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忍者中的忍者（暂译，日文︰シノビの中のシノビ，英文︰A Ninja Amongst Ninjas）是以半藏为主角的剧本，通关家康剧情后可以进入。
来合战吧！
| 来合战吧！
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| 主角
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女忍
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| 国家
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东部8国
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| 目标
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统一8国
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| 开启条件
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通关武将的生存方式
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| 难度
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★★★☆☆
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| 描述
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来合战吧！（暂译，日文︰イクサしちゃうぜい！，英文︰Time for Battle!）是以女忍为主角的剧本，通关幸村剧情后可以进入。
初始状态
通关
非官方译名 
